Milan Žust è nato nel 1967 a Lubiana, in Slovenia, e ha vissuto in un piccolo paese, Hleviše. Dopo il liceo scientifico è entrato nella Compagnia di Gesù nel 1986. Ha studiato filosofia e teologia a Lubiana e a Innsbruck. E’ stato ordinato sacerdote nel 1996. Un anno dopo ha conseguito la licenza al Pontificio Istituto Orientale a Roma. Nel 2002 ha conseguito il dottorato in teologia all’Institut Catholique, all’Istituto di Teologia Ortodossa e all’Università Sorbona a Parigi con una tesi su Pavel Florenskij. Dal 2000 è membro dell’equipe del Centro Aletti e dal 2004 il superiore della comunità dei gesuiti. Dal 2003 al 2008 ha insegnato alla Facoltà di missiologia della Pontificia Università Gregoriana a Roma. Dal 2006 al 2013 ha lavorato al Pontificio consiglio per la promozione dell’unità dei cristiani, curando le relazioni con le Chiese ortodosse dei Paesi slavi e la Georgia e occupandosi delle borse di studio degli studenti ortodossi. Dal 2010 è consigliere del Superiore Generale della Compagnia di Gesù per le relazioni ecumeniche con le Chiese orientali non cattoliche. Dal 2013 insegna nuovamente alla Facoltà di missiologia della Pontificia Università Gregoriana, di cui è stato anche il decano nel triennio 2015-18. Dal settembre 2018 al 2021 è stato socio del Delegato del Superiore Generale per le case e opere interprovinciali di Roma.